（一）市政府工作部门
荆州市人民政府办公室
荆州市发展和改革委员会
荆州市教育局
荆州市科学技术局
荆州市经济和信息化局
荆州市民族宗教事务委员会
荆州市公安局
荆州市民政局
荆州市司法局
荆州市财政局
荆州市人力资源和社会保障局
荆州市自然资源和城乡建设局
荆州市生态环境局
荆州市住房和城市更新局
荆州市交通运输局
荆州市水利和湖泊局
荆州市农业农村局
荆州市商务局
荆州市文化和旅游局
荆州市卫生健康委员会
荆州市退役军人事务局
荆州市应急管理局
荆州市审计局
荆州市人民政府国有资产监督管理委员会
荆州市市场监督管理局
荆州市统计局
荆州市医疗保障局
荆州市国防动员办公室
荆州市人民政府研究室
荆州市城市管理执法委员会
荆州市信访局
荆州市数据局
（二）市政府派出机构
荆州经济技术开发区管理委员会
荆州楚纪南城大遗址保护区管理委员会（荆州纪南生态文化旅游区管理委员会）
荆州高新技术产业开发区管理委员会
湖北洪湖国家级自然保护区管理局
（三）市政府直属事业单位
荆州市机关事务服务中心
荆州市招商促进中心
荆州住房公积金中心
（四）特殊经济组织
荆州市供销合作社联合社
